澳大工程理學士學位在2012年通過第一次認證後，於2016年再一次通過香港工程師學會的全面評鑑。是次全面評鑑覆蓋及認可自2011／2012年至2018／2019年入讀的所有科技學院工程理學士學位課程的學生。這次認證是澳大科技學院學術課程被世界工程教育認可的最大肯定。
香港工程師學會是華盛頓協議國際工程學科認證組織的一員，也是香港唯一的法定專業工程師學會，負責擬定專業工程師訓練與審核標準，致力推動香港工程師資格互認工作，及為工程學位課程進行學術評審。是次學術評審的四大範疇包括：一、校方對學術評審的支持及未來發展；二、科技學院的整體運作；三、各學系對教師發展、學生培訓及課程的管理；四、課程的教學內容及對學生就業與升學的準備。
為深入瞭解科技學院，香港工程師學會評審團隊於2015年與澳門工程師學會代表分別會見了澳大校長、副校長、科技學院院長及學院全體教學人員、學院及學系顧問、校友及各級學生代表。評審團隊指出，澳大擁有高質素的教學人員，學術基礎穏固，資源豐厚，相信定能為入讀上述課程的學生提供高質素的教育。
香港工程師學會評審團隊於2015年為澳大科技學院完成全面評鑑後，正式給予三個工程理學士學位全面學術認可
